Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms