Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx1Q9ER42 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms