Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms