Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ndufa8Q9DCJ5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms