Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pop7Q9DCH2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop7Q9DCH2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms