Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Swt1Q9DBQ9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Swt1Q9DBQ9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms