Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms