Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4bQ9D9F7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms