Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tvp23bQ9D8T4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms