Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms