Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
U2af1Q9D883 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1Q9D883 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms