Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmigd1Q9D7L8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms