Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Borcs8Q9D6Y4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Borcs8Q9D6Y4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Borcs8Q9D6Y4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms