Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Ttc9bQ9D6E4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Ttc9bQ9D6E4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Ttc9bQ9D6E4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc9bQ9D6E4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc9bQ9D6E4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms