Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930449I24RikQ9D5E3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms