Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms