Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lonrf3Q9D4H7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms