Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms