Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933421I07RikQ9D420 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933421I07RikQ9D420 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms