Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms