Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syf2Q9D198 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms