Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms