Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acsl3Q9CZW4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acsl3Q9CZW4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms