Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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