Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms