Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrs1Q9CYH6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms