Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms