Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmed5Q9CXE7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed5Q9CXE7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms