Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Sycp2Q9CUU3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms