Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fcf1Q9CTH6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fcf1Q9CTH6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fcf1Q9CTH6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fcf1Q9CTH6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcf1Q9CTH6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms