Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CR55 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CR55 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CR55 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CR55 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CR55 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CR55 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CR55 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CR55 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CR55 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CR55 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CR55 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CR55 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CR55 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CR55 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CR55 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CR55 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CR55 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CR55 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CR55 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms