Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska2Q9CR46 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms