Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms