Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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