Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms