Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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