Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg3Q9CPX6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms