Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930519G04RikQ9CPT7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms