Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl17Q9CPR4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms