Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt23Q99PS0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms