Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bco2Q99NF1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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