Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rims1Q99NE5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms