Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcgf6Q99NA9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms