Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh8Q99NA2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atoh8Q99NA2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms