Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp1b4Q99ME6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms