Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp16Q99LG0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms