Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtcbQ99LF4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RtcbQ99LF4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms