Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms