Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec3Q99J72 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms