Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Prss28Q924N9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prss28Q924N9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms